Fort-Dauphin est une région qui est limitée d’un côté par une végétation dense et de l’autre, par l’Océan Indien. Parmi les sites à ne pas manquer par les amoureux de la nature, il y a le pic Saint Louis. Un circuit de trekking permet d’y accéder et tout au long du trajet, l’on rencontrera de nombreuses espèces végétales uniques à Madagascar. Parmi celles-ci, on compte de multiples variétés d’orchidées ainsi que des ravenalas, une végétation typique des régions sud de la Grande île. Quelques représentations de cette végétation riche sont présentes au jardin botanique Saïadi, en plus de plusieurs espèces d’animaux tout aussi endémiques tels que les makis et les sifakas. Une fois au sommet du pic, le regard se posera sur d’autres sites secondaires dont l’anse Dauphine, la fausse baie des Galions ou encore le cap Ranavalona. La ville propose aussi trois réserves naturelles dont la visite représente des activités à privilégier lors d’un passage à Fort-Dauphin. La réserve de Berenty permet de découvrir deux grands sites incontournables : une réserve naturelle qui rassemble plusieurs espèces de plantes carnivores népenthès ainsi qu’une forêt, lieu où prédomine de multiples espèces de plantes épineuses. La région est également connue pour ses immenses plantations de sisal. Toute la végétation du site représente un environnement de choix pour de nombreuses espèces faunistiques. Les lémuriens y sont présents en grand nombre et n’hésitent pas à aller à la rencontre des visiteurs qui viennent sur le site. D’autres espèces dont les serpents et les crocodiles sont également à découvrir lors d’une visite de ce site naturel. La réserve de Nahampoana fait partie des trois sites incontournables de la région de Fort-Dauphin. Elle est localisée à seulement 7 km de la grande-ville et se caractérise par ses lagons naturels qui permettent des baignades inédites. Le site abrite aussi une forêt de bambous dans laquelle s’établissent facilement crocodiles, lémuriens et tortues. À 40 km de la ville principale se situe le parc d’Andohalela, un véritable havre de paix pour de nombreuses espèces végétales et faunistiques dont la plupart sont endémiques. Le site abrite notamment une espèce de lézard appelée Iguanidaes, présente uniquement dans la Grande île et en Amérique Latine. Le fameux lémurien à collier roux y a aussi élu domicile ainsi que plusieurs espèces de la même famille. En ce qui concerne sa richesse florale, le parc présente de nombreuses plantes endémiques dont le palmier trièdre appelé Vanilla Madagascarinsis.